RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.79■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.79■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 FANCCQ00597 558 aa23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 ORAI2Q96SN7 254 aa23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.78■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PQ27 194 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PQ64 194 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PQD8 194 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 ATF3P18847 181 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 SLC20A2Q08357 652 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 MNS1Q8NEH6 495 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 SMARCE1Q969G3 411 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.77■■□□□ 1.4
PMS1-222ENST00000639501 NLRP12P59046 1061 aa23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D8O95759 1140 aa23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.76■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 PDIA6Q15084 440 aa23.75■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 STK38Q15208 465 aa23.75■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.75■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 USP54Q70EL1 1684 aa23.75■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 ZNF202O95125 648 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 EVCP57679 992 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 HAUS7Q99871 368 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TMEM232C9JQI7 657 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 E7EWF7 191 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 IP6K1Q92551 441 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TMX1Q9H3N1 280 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 NRDCO43847 1150 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TUBB4AP04350 444 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TPM4P67936 248 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 GCKRQ14397 625 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 COPRSQ9NQ92 184 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 SPTLC2O15270 562 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 PFKFB1P16118 471 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 DCCP43146 1447 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 KIF28PB7ZC32 967 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 GYS2P54840 703 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TEX35Q5T0J7 233 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 TMEM139Q8IV31 216 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 WDR24Q96S15 920 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-222ENST00000639501 MYL6BP14649 208 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PSME1Q06323 249 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MYD88Q99836 296 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 UBASH3AP57075 661 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MST1RQ04912 1400 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 GOLIM4O00461 696 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 IKBKBO14920 756 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 CCP110O43303 1012 aa23.68■■□□□ 1.38
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