RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 GPTP24298 496 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 RTN1Q16799 776 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 KIFAP3Q92845 792 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 PTPRGP23470 1445 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 PPARDQ03181 441 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RILPQ96NA2 401 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB43O43298 467 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 IGSF3O75054 1194 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RUFY3Q7L099 469 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 NAPAP54920 295 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 DHX58Q96C10 678 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 AK9Q5TCS8 1911 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 CASC4Q6P4E1 433 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MORC4Q8TE76 937 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 I3L4J1 428 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 BMP15O95972 392 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT23Q9C075 422 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RTL1A6NKG5 1358 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 STX10O60499 249 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 GSTO1P78417 241 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 COG7P83436 770 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 LCA5Q86VQ0 697 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 OPHN1O60890 802 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SPAG1Q07617 926 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC8A3P57103 927 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 LDHCP07864 332 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 INPP5BP32019 993 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC38Q502W7 563 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 GBP5Q96PP8 586 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MX2P20592 715 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS6KA2Q15349 733 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 NDUFAB1O14561 156 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 F6X3S4 739 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SPOPO43791 374 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 NECAB1Q8N987 351 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 USP48Q86UV5 1035 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR44Q5JSH3 913 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ERBINQ96RT1 1412 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRKQ9NRH2 765 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V1E1P36543 226 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF365Q70YC5 407 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO10Q9HD67 2058 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRJ-207ENST00000613246 NACA2Q9H009 215 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 MUM1Q2TAK8 710 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT2P35908 639 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRJ-207ENST00000613246 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms