RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 GNAT2P19087 354 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 CALML3P27482 149 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 CHST3Q7LGC8 479 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 CHMLP26374 656 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 IFT81Q8WYA0 676 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 PBRM1Q86U86 1689 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 ATL3Q6DD88 541 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 RAD50Q92878 1312 aa13.52□□□□□ -0.24
TNS1-220ENST00000611415 ATP2A1O14983 1001 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PHACTR2O75167 634 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TUBBP07437 444 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 FAM76AQ8TAV0 307 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TRAF1Q13077 416 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ELP1O95163 1332 aa13.52□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 RLBP1P12271 317 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MCM7P33993 719 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PPP2R3AQ06190 1150 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SEC24BO95487 1268 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ST5P78524 1137 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CNGA4Q8IV77 575 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ZEB2O60315 1214 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ADAMTS2O95450 1211 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 GJC1P36383 396 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 VAV2P52735 878 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 KRT79Q5XKE5 535 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 LRRC45Q96CN5 670 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ERO1AQ96HE7 468 aa13.51□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TNNC1P63316 161 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 RBSNQ9H1K0 784 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SMC6Q96SB8 1091 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 VAMP4O75379 141 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MYL5Q02045 173 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PSMD1Q99460 953 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PLCH2O75038 1416 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SMIM23A6NLE4 172 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TERF1P54274 439 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB16Q05516 673 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TFCP2Q12800 502 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 FAM13AO94988 1023 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CEP57Q86XR8 500 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CCDC63Q8NA47 563 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 NBPF4Q96M43 638 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CCDC114Q96M63 670 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CTNND2Q9UQB3 1225 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MSH6P52701 1360 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 EVCP57679 992 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 GTF3C6Q969F1 213 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 RFC4P35249 363 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MAGEB6Q8N7X4 407 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB9Q96C00 473 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 PIK3C2GO75747 1445 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 SLC39A6Q13433 755 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 DAAM2Q86T65 1068 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 TSPYL6Q8N831 410 aa13.48□□□□□ -0.25
TNS1-220ENST00000611415 A0A1B0GVL5 298 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms