RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597318.5

PCBP1-AS1-251, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.2□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CCDC69A6NI79 296 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 OATP04181 439 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PPP2R1AP30153 589 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 GJA8P48165 433 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 GNAI1P63096 354 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MAP3K9P80192 1104 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CCZ1BP86790 482 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PKP1Q13835 747 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ZNF280DQ6N043 979 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 HOMER1Q86YM7 354 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 BHMTQ93088 406 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 VCPKMTQ9H867 229 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 RAB21Q9UL25 225 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 GMEB1Q9Y692 573 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 WDR62O43379 1518 aa6.19□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 IQGAP2Q13576 1575 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ERBINQ96RT1 1412 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FANCAO15360 1455 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 SMAPO00193 183 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 STK25O00506 426 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 AP5Z1O43299 807 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CEP104O60308 925 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 DESP17661 470 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FNTAP49354 379 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TMF1P82094 1093 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PPFIA1Q13136 1202 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CUL3Q13618 768 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 VPS53Q5VIR6 699 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TRIM4Q9C037 500 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CBX8Q9HC52 389 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 AK9Q5TCS8 1911 aa6.18□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 GRIN2BQ13224 1484 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CREB3O43889 395 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 RASSF9O75901 435 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ECEL1O95672 775 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MYL1P05976 194 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 ATP5JP18859 108 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 PAX3P23760 479 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.17□□□□□ -1.42
PCBP1-AS1-251ENST00000597318 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms