RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	VPS37D	Q86XT2	251 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TPCN1-222	ENST00000552897	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
TPCN1-222	ENST00000552897	HSPA6	P17066	643 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	CNTROB	Q8N137	903 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A1B0GUL7	405 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	PHKA1	P46020	1223 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	GRIK5	Q16478	980 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	XAGE2	Q96GT9	111 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	29.9	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	CRBN	Q96SW2	442 aa		29.9	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	PASK	Q96RG2	1323 aa		29.9	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897		F8W031	263 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TPCN1-222	ENST00000552897	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	HTRA3	P83110	453 aa		29.88	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC102B	Q68D86	513 aa		29.88	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	SCARF1	Q14162	830 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	OGFOD1	Q8N543	542 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	TRAF5	O00463	557 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	DLK2	Q6UY11	383 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	GPR108	Q9NPR9	543 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.86	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	APLP1	P51693	650 aa		29.85	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	HMMR	O75330	724 aa		29.84	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	WNT10B	O00744	389 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	GGA3	Q9NZ52	723 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		29.83	■■■□□ 2.37
TPCN1-222	ENST00000552897	USP48	Q86UV5	1035 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	AOX1	Q06278	1338 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	MMP14	P50281	582 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	RASGRF1	Q13972	1273 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB22	O15209	634 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	CFAP100	Q494V2	611 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		29.8	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	APBB1	O00213	710 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	ADM5	C9JUS6	153 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	SEMA3E	O15041	775 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	DLGAP5	Q15398	846 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	GORAB	Q5T7V8	394 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	PI16	Q6UXB8	463 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TPCN1-222	ENST00000552897	CST9	Q5W186	159 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	CEP350	Q5VT06	3117 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	SPDYE6	P0CI01	402 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	PRDX5	P30044	214 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	CRK	P46108	304 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	RAB11FIP3	O75154	756 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	MCAM	P43121	646 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	29.73	■■■□□ 2.35

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