RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539982.5

CLSTN3-209, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLSTN3-209ENST00000539982 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLSTN3-209ENST00000539982 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN3-209ENST00000539982 BRCA2P51587 3418 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLSTN3-209ENST00000539982 FOXO4P98177 505 aa14.82□□□□□ -0.04
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CLSTN3-209ENST00000539982 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.82□□□□□ -0.04
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CLSTN3-209ENST00000539982 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 VGLL4Q14135 290 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 KIF22Q14807 665 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 CSADQ9Y600 493 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 CEP290O15078 2479 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-209ENST00000539982 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.8□□□□□ -0.04
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