RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	KIF3C	O14782	793 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	AOX1	Q06278	1338 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	IL1R1	P14778	569 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	MYH7	P12883	1935 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	MCAM	P43121	646 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	PRDX5	P30044	214 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	BRCA2	P51587	3418 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	EPHX2	P34913	555 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TNIP1	Q15025	636 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	GML	Q99445	158 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CHGB	P05060	677 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ZAP70	P43403	619 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CACNB3	P54284	484 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.37	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	HTRA3	P83110	453 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.36	□□□□□ -0.59

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