RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523334.1

HDAC2-215, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 2

Gene HDAC2, Length 4,810 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-215	ENST00000523334	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	FGA	P02671	866 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TTC14	Q96N46	770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	KRT23	Q9C075	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	LDHC	P07864	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	BCAM	P50895	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	WASF1	Q92558	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	BECN2	A8MW95	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ZBTB43	O43298	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	DTNB	O60941	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	AFF2	P51816	1311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ADD2	P35612	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MCAM	P43121	646 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	USP5	P45974	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MRC1	P22897	1456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SNAP23	O00161	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	GYG1	P46976	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	WTAP	Q15007	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ESR2	Q92731	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334		B4E1Z4	1266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334		M0R2C6	588 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	JAK2	O60674	1132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	LARGE1	O95461	756 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	BAG3	O95817	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	SCARF1	Q14162	830 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CERK	Q8TCT0	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	NRDC	O43847	1150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	DDIT3	P35638	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TPM4	P67936	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC2-215	ENST00000523334	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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