RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512944.5

EXOC3-209, Transcript of exocyst complex component 3, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EXOC3, Length 2,825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOC3-209	ENST00000512944	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	STK38	Q15208	465 aa		29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	LINS1	Q8NG48	757 aa		29.77	■■■□□ 2.36
EXOC3-209	ENST00000512944	ISM2	Q6H9L7	571 aa		29.76	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	CLIC4	Q9Y696	253 aa		29.76	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	GPS2	Q13227	327 aa		29.76	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		29.76	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		29.76	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.75	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		29.75	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		29.75	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	ATP5J	P18859	108 aa		29.74	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	PSME1	Q06323	249 aa		29.74	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	DPF2	Q92785	391 aa		29.74	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	UTY	O14607	1347 aa		29.74	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.73	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	ZSCAN26	Q16670	478 aa		29.73	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		29.73	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		29.73	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	TMX1	Q9H3N1	280 aa		29.73	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	ZNF202	O95125	648 aa		29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	UBASH3A	P57075	661 aa		29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.72	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	GYS2	P54840	703 aa		29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	PTPN21	Q16825	1174 aa		29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		29.71	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	IKBKB	O14920	756 aa		29.7	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	SERPINC1	P01008	464 aa		29.7	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	CHST3	Q7LGC8	479 aa		29.7	■■■□□ 2.35
EXOC3-209	ENST00000512944	SPTLC2	O15270	562 aa		29.7	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		29.7	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	ZSCAN12	O43309	604 aa		29.69	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		29.69	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	CFAP100	Q494V2	611 aa		29.69	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944		A0A0G2JLW4	131 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	CASQ1	P31415	396 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	WDR24	Q96S15	920 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	MRC1	P22897	1456 aa		29.68	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	FUT8	Q9BYC5	575 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	CBFA2T2	O43439	604 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	GNG11	P61952	73 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TFCP2	Q12800	502 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	NBPF4	Q96M43	638 aa		29.67	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TMEM232	C9JQI7	657 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	YEATS4	O95619	227 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	IGKV5-2	P06315	115 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TRIM66	O15016	1216 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	PFKFB1	P16118	471 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	VSTM4	Q8IW00	320 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		29.66	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	MYO1C	O00159	1063 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	AK7	Q96M32	723 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		29.65	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944		E7EWF7	191 aa		29.64	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	LMAN1	P49257	510 aa		29.64	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	TMEM139	Q8IV31	216 aa		29.64	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	ABTB2	Q8N961	1025 aa		29.64	■■■□□ 2.34
EXOC3-209	ENST00000512944	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		29.64	■■■□□ 2.34

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