RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504015.2

ALYREF-201, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 254 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-201ENST00000504015 ADD2P35612 726 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ZNF165P49910 485 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CTSWP56202 376 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TRDNQ13061 729 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PPP2R5BQ15173 497 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 WASHC4Q2M389 1173 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 METTL24Q5JXM2 366 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ADALQ6DHV7 355 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 STOX1Q6ZVD7 989 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 FERMT3Q86UX7 667 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NLRP10Q86W26 655 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 BICD2Q8TD16 824 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 OSBP2Q969R2 916 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PGBD1Q96JS3 809 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TMEM87BQ96K49 555 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 WNK3Q9BYP7 1800 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.55□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 RREB1Q92766 1687 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NUP98P52948 1817 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 M0R2C6 588 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 EXOC5O00471 708 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PRC1O43663 620 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 MYO1BO43795 1136 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NR1I2O75469 434 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ITGA6P23229 1130 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ZAP70P43403 619 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NT5C2P49902 561 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 RCAN1P53805 252 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 APOBRQ0VD83 1088 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 STX1AQ16623 288 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PARP10Q53GL7 1025 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TMTC2Q8N394 836 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 JMYQ8N9B5 988 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PIGBQ92521 554 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 LPIN2Q92539 896 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 WASF1Q92558 559 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 FAM89AQ96GI7 184 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 C8orf76Q96K31 380 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TIGD1Q96MW7 591 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CBX8Q9HC52 389 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 STRN4Q9NRL3 753 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ANO10Q9NW15 660 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 LAMB2P55268 1798 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 RIC1Q4ADV7 1423 aa4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 NID2Q14112 1375 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 DOCK2Q92608 1830 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 STK36Q9NRP7 1315 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 C4AP0C0L4 1744 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 C4BP0C0L5 1744 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.53□□□□□ -1.68
ALYREF-201ENST00000504015 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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