RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC10A3	P09131	477 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	GYG1	P46976	350 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CA12	O43570	354 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PRKG1	Q13976	671 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CCER2	I3L3R5	266 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MMP14	P50281	582 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	FKBP1B	P68106	108 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD8	Q96I13	439 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	FZD1	Q9UP38	647 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	AOX1	Q06278	1338 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TRPA1	O75762	1119 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	NF2	P35240	595 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	VEZT	Q9HBM0	779 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OTOF	Q9HC10	1997 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MYO1B	O43795	1136 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PDE8B	O95263	885 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DGKZ	Q13574	1117 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GRIK5	Q16478	980 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	BCAM	P50895	628 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SIL1	Q9H173	461 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LAMB1	P07942	1786 aa		18.33	■□□□□ 0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	EYA2	O00167	538 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CRK	P46108	304 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	RASA3	Q14644	834 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	FGFR2	P21802	821 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	MEIS3	Q99687	375 aa		18.3	■□□□□ 0.52

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