RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	USP17L8	P0C7I0	530 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275		A0A1B0GUL7	405 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	CRBN	Q96SW2	442 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	XAGE2	Q96GT9	111 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	HMMR	O75330	724 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	PHKA1	P46020	1223 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	GPR108	Q9NPR9	543 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC102B	Q68D86	513 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	TNNI3K	Q59H18	835 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	HSPA6	P17066	643 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
TTC3-223	ENST00000492275		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB22	O15209	634 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	MMP14	P50281	582 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	GRIK5	Q16478	980 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	SCARF1	Q14162	830 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	PASK	Q96RG2	1323 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	SEMA3E	O15041	775 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
TTC3-223	ENST00000492275	WNT10B	O00744	389 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	RASGRF1	Q13972	1273 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	GORAB	Q5T7V8	394 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	APBB1	O00213	710 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	RAB11FIP3	O75154	756 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	31.75	■■■□□ 2.67	3e-10	■■■□□ 15.6
TTC3-223	ENST00000492275	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	TRAF5	O00463	557 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	APLP1	P51693	650 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	GGA3	Q9NZ52	723 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	CFAP100	Q494V2	611 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	DLGAP5	Q15398	846 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	USP48	Q86UV5	1035 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	DCTPP1	Q9H773	170 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	DLK2	Q6UY11	383 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	AACS	Q86V21	672 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC3-223	ENST00000492275	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC3-223	ENST00000492275	MCAM	P43121	646 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC3-223	ENST00000492275	HTRA3	P83110	453 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC3-223	ENST00000492275	PI16	Q6UXB8	463 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC3-223	ENST00000492275	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		31.69	■■■□□ 2.66

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