RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 IGLV1-40P01703 118 aa7.1□□□□□ -1.27
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VPS13A-211ENST00000484581 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
VPS13A-211ENST00000484581 MPSTP25325 297 aa7.1□□□□□ -1.27
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VPS13A-211ENST00000484581 CITED4Q96RK1 184 aa7.1□□□□□ -1.27
VPS13A-211ENST00000484581 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.1□□□□□ -1.27
VPS13A-211ENST00000484581 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.1□□□□□ -1.27
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VPS13A-211ENST00000484581 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
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VPS13A-211ENST00000484581 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.04□□□□□ -1.28
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VPS13A-211ENST00000484581 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.03□□□□□ -1.28
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VPS13A-211ENST00000484581 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.03□□□□□ -1.28
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VPS13A-211ENST00000484581 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 TM4SF5O14894 197 aa7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 GPR182O15218 404 aa7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 ADAM11O75078 769 aa7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 MED26O95402 600 aa7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 BMP3P12645 472 aa7.02□□□□□ -1.29
VPS13A-211ENST00000484581 IRAK1P51617 712 aa7.02□□□□□ -1.29
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