RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRB3O60242 1522 aa18.98■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.98■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR78Q5VTH9 848 aa18.98■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FEZ1Q99689 392 aa18.98■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTL1A6NKG5 1358 aa18.98■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.98■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS36Q86VN1 386 aa18.97■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.97■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.97■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JADE2Q9NQC1 790 aa18.97■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNC1I1O14576 645 aa18.97■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNI3KQ59H18 835 aa18.97■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.97■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.97■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC27A2O14975 620 aa18.96■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAT6P42226 847 aa18.96■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EYA2O00167 538 aa18.96■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF521Q96K83 1311 aa18.96■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B4E1Z4 1266 aa18.96■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.637e-6■□□□□ 11.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DRC1Q96MC2 740 aa18.95■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP6P35125 1406 aa18.95■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLIN2Q99541 437 aa18.95■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.95■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf37Q96NL8 207 aa18.94■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP44Q9H0E7 712 aa18.94■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMM50Q9Y512 469 aa18.94■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS6KB1P23443 525 aa18.94■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 18.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLI2P10070 1586 aa18.94■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC1Q9NV70 894 aa18.94■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF20AO95235 890 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL17REQ8NFR9 667 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAD50Q92878 1312 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDM1O75626 825 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP9Q49MG5 647 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTG4Q9NY30 223 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAPAP54920 295 aa18.93■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASIC1P78348 528 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPECC1Q5M775 1068 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA6Q8N139 1617 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGA6P23229 1130 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCKRQ14397 625 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CABP5Q9NP86 173 aa18.92■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCM7P33993 719 aa18.91■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOPCQ9HD26 462 aa18.91■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.91■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JAK2O60674 1132 aa18.91■□□□□ 0.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKP1Q13835 747 aa18.91■□□□□ 0.62
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