RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-205	ENST00000466861	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861		A0A1B0GUL7	405 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	POTEI	P0CG38	1075 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	POTEJ	P0CG39	1038 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	TIMM10	P62072	90 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	RAB11FIP3	O75154	756 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	CERS5	Q8N5B7	392 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	MXD3	Q9BW11	206 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SUMO3-205	ENST00000466861	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	CRBN	Q96SW2	442 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	HSPA6	P17066	643 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	ADORA1	P30542	326 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	PHKA1	P46020	1223 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	GORAB	Q5T7V8	394 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	MRI	Q9BWK5	157 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	EGFR	P00533	1210 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	MAST3	O60307	1309 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	PASK	Q96RG2	1323 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SUMO3-205	ENST00000466861	WNT10B	O00744	389 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	APLP1	P51693	650 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	DCTPP1	Q9H773	170 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	SCARF1	Q14162	830 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	DLGAP5	Q15398	846 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	IGSF3	O75054	1194 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	GGA3	Q9NZ52	723 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861		F8W031	263 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	CFAP100	Q494V2	611 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	AACS	Q86V21	672 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	SULF1	Q8IWU6	871 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SUMO3-205	ENST00000466861	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	MYO1B	O43795	1136 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	SPDYE6	P0CI01	402 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SUMO3-205	ENST00000466861	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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