RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 TFCP2Q12800 502 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-206ENST00000462743 VPS37DQ86XT2 251 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-206ENST00000462743 OGFOD1Q8N543 542 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-206ENST00000462743 CERS5Q8N5B7 392 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-206ENST00000462743 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-206ENST00000462743 MXD3Q9BW11 206 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-206ENST00000462743 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 EGFRP00533 1210 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TIMM10P62072 90 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 MRIQ9BWK5 157 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 A0A1B0GUL7 405 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 SEMA3EO15041 775 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 HMMRO75330 724 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 FBXW7Q969H0 707 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 XAGE2Q96GT9 111 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 WNT10BO00744 389 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 SCARF1Q14162 830 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 CCDC102BQ68D86 513 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 ADORA1P30542 326 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 PHKA1P46020 1223 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 CREBZFQ9NS37 354 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 RAB11FIP3O75154 756 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TNNI3KQ59H18 835 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-206ENST00000462743 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 AAMPQ13685 434 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 DLGAP5Q15398 846 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 USP48Q86UV5 1035 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 JAG2Q9Y219 1238 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 GRIK5Q16478 980 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 CFAP100Q494V2 611 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 CST9Q5W186 159 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 GGA3Q9NZ52 723 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 TRAF5O00463 557 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 SPDYE6P0CI01 402 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 RASGRF1Q13972 1273 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 SULF1Q8IWU6 871 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 MAST3O60307 1309 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 F8W031 263 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 IGSF3O75054 1194 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 GORABQ5T7V8 394 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 DCTPP1Q9H773 170 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.86□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 CRKP46108 304 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.85□□□□□ -0.03
HPS1-206ENST00000462743 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms