RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441692.5

THOC2-208, Transcript of THO complex 2, human

TSL 5

Gene THOC2, Length 4,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THOC2-208	ENST00000441692	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	MYD88	Q99836	296 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	BBOX1	O75936	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	HOXB7	P09629	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	WBP1L	Q9NX94	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SASH1	O94885	1247 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	GRM8	O00222	908 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TULP2	O00295	520 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	PTH1R	Q03431	593 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CXCL9	Q07325	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	AACS	Q86V21	672 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ST18	O60284	1047 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	KCNA3	P22001	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	C5	P01031	1676 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NBPF26	B4DH59	902 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	SGSM2	O43147	1006 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	GCKR	Q14397	625 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	HLF	Q16534	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THOC2-208	ENST00000441692	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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