RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VEZT	Q9HBM0	779 aa		12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLAIN2	Q9P270	581 aa		12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCM8	Q9UJA3	840 aa		12.08	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCP110	O43303	1012 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRDC	O43847	1150 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR24	Q96S15	920 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSME1	Q06323	249 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEX11	Q8IYF3	940 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERCC3	P19447	782 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD248	Q9HCU0	757 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFNK	Q9P0W0	207 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCT5	P48643	541 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNG11	P61952	73 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDR1	Q08345	913 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCC6	O95255	1503 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXO3	O43524	673 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CABS1	Q96KC9	395 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MEIS3	Q99687	375 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP5	P45974	858 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASP8	Q14790	479 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX11	Q96FC9	970 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNKP	Q96T60	521 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INPP5B	P32019	993 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NF2	P35240	595 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ME3	Q16798	604 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX58	Q96C10	678 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANO10	Q9NW15	660 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EBAG9	O00559	213 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TATDN2	Q93075	761 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITFG2	Q969R8	447 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MBIP	Q9NS73	344 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB21	Q9UL25	225 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL18A1	P39060	1754 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO1F	O00160	1098 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHLPP1	O60346	1717 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF40	O75150	1001 aa		12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP2B2	Q01814	1243 aa		12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.02	□□□□□ -0.48
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48

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