RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415107.5

ATG4B-207, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-207ENST00000415107 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 SCNN1DP51172 638 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 IGHDP01880 384 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 AACSQ86V21 672 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 POTECB2RU33 542 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 GTF2IP78347 998 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 RASGRF1Q13972 1273 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 MCAMP43121 646 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 GORABQ5T7V8 394 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 NUCB1Q02818 461 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 CERS5Q8N5B7 392 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 MRIQ9BWK5 157 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 HACL1Q9UJ83 578 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-207ENST00000415107 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 DOCK2Q92608 1830 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ATP5JP18859 108 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 SPATA5Q8NB90 893 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 MAST3O60307 1309 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 APBB1O00213 710 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 USP17L8P0C7I0 530 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 GPATCH3Q96I76 525 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 AOX1Q06278 1338 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 H7C1D1 291 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 KIF3CO14782 793 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 EPHX2P34913 555 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 SCARF1Q14162 830 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 MICALL2Q8IY33 904 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 OGFOD1Q8N543 542 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 STAP2Q9UGK3 403 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 HAUS7Q99871 368 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 MX1P20591 662 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 EPS15P42566 896 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 FBXW7Q969H0 707 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 MXD3Q9BW11 206 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 RRAGCQ9HB90 399 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 GAKO14976 1311 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 ERC2O15083 957 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 PRDX5P30044 214 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 PI16Q6UXB8 463 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-207ENST00000415107 TICAM2Q86XR7 235 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 866.7 ms