RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 UFL1O94874 794 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PSMD2Q13200 908 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 DAAM2Q86T65 1068 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 DDX12PQ92771 950 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PLVAPQ9BX97 442 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 FBXW4P57775 412 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PLCB4Q15147 1175 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CCDC157Q569K6 752 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CYP7A1P22680 504 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 IFT74Q96LB3 600 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TIGD1Q96MW7 591 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 APOBRQ0VD83 1088 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.69□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 STRN3Q13033 797 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 UBE4AQ14139 1066 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MAP7D1Q3KQU3 841 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MCM10Q7L590 875 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 FNBP1Q96RU3 617 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GMNNO75496 209 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CRCPO75575 148 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 KCNA6P17658 529 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 IDEP14735 1019 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PTGDRQ13258 359 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 BIRC3Q13489 604 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CFAP45Q9UL16 551 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PDE6AP16499 860 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TTLL6Q8N841 843 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CHST3Q7LGC8 479 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TMOD1P28289 359 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PSMC4P43686 418 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TAF3Q5VWG9 929 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 OPA1O60313 960 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GNAT1P11488 350 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.662e-6■■■■□ 24.9
CENPF-201ENST00000366955 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MED10Q9BTT4 135 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 DAPK1P53355 1430 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 LMBR1LQ6UX01 489 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.68□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GNPTABQ3T906 1256 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 UBA7P41226 1012 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 KCTD2Q14681 263 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GEN1Q17RS7 908 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CCER2I3L3R5 266 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CDC45O75419 566 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 GOLGA8BA8MQT2 603 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 KIF11P52732 1056 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PARP10Q53GL7 1025 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 TRPC3Q13507 836 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 UNC5CLQ8IV45 518 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 KIFC2Q96AC6 838 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.67□□□□□ -1.66
CENPF-201ENST00000366955 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms