RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RIMBP2O15034 1052 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HTR3AP46098 478 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 STRIP2Q9ULQ0 834 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KIF3BO15066 747 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PROX2Q3B8N5 592 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GRIPAP1Q4V328 841 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HS2ST1Q7LGA3 356 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf58Q8NDZ4 430 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-9P63128 1117 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NCOA1Q15788 1441 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PACS2Q86VP3 889 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FANCLQ9NW38 375 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DLEC1Q9Y238 1755 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CASP7P55210 303 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KRT72Q14CN4 511 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SERINC2Q96SA4 455 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FEZ1Q99689 392 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAG3Q9UGI9 489 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LHX6Q9UPM6 363 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FMN2Q9NZ56 1722 aa3.32□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SMAPO00193 183 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CDC45O75419 566 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GALEQ14376 348 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ODR4Q5SWX8 454 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ANKS3Q6ZW76 656 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SLITRK4Q8IW52 837 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 APPBP2Q92624 585 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA2Q9UL42 364 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ASXL2Q76L83 1435 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC37A3O60309 1634 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 VEGFBP49765 207 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 MKNK1Q9BUB5 465 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC3Q9BY71 257 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 POLIQ9UNA4 740 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 UACAQ9BZF9 1416 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CFHP08603 1231 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 STAT3P40763 770 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 EPHB1P54762 984 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RASSF7Q02833 373 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CKAP2LQ8IYA6 745 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT12Q8IYM1 358 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NIF3L1Q9GZT8 377 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GINM1Q9NU53 330 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 METRNQ9UJH8 293 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 COL18A1P39060 1754 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ABCC6O95255 1503 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ATAD2Q6PL18 1390 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GRIN2CQ14957 1233 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GGNBP2Q9H3C7 697 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 BCS1LQ9Y276 419 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA3Q08378 1498 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GIPRP48546 466 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 Q3C1V9 767 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ERAP2Q6P179 960 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC7Q99615 494 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRL2O95490 1459 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RFPL1O75677 317 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TYRP1P17643 537 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 MEI1Q5TIA1 1274 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FAM169BQ8N8A8 192 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.2 ms