RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 A0A1B0GUL6 1792 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 DLGAP5Q15398 846 aa22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HDDC3-201ENST00000330334 PDE8BO95263 885 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 SLC10A3P09131 477 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 ZIC5Q96T25 663 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.26■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 NF2P35240 595 aa22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 GYG1P46976 350 aa22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC24Q50LG9 513 aa22.25■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 METTL24Q5JXM2 366 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 MYO1BO43795 1136 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 SPDYE6P0CI01 402 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 FBXO3Q9UK99 471 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 KIF16BQ96L93 1317 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 CFAP100Q494V2 611 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 VPS37DQ86XT2 251 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-201ENST00000330334 F8W031 263 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 EYA2O00167 538 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 FGFR2P21802 821 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 CSRNP1Q96S65 589 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 JAG2Q9Y219 1238 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 MOB2Q70IA6 237 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 TSKSQ9UJT2 592 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 CAPN15O75808 1086 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 CIAO1O76071 339 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 MRIQ9BWK5 157 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 UNCXA6NJT0 531 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 LPIN2Q92539 896 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 RNF186Q9NXI6 227 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 MAP3K11Q16584 847 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 BCAMP50895 628 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-201ENST00000330334 CLRN2A0PK11 232 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 GNAI3P08754 354 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SLC5A1P13866 664 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 TNFAIP1Q13829 316 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 MIER1Q8N108 512 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZBTB22O15209 634 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 TRPA1O75762 1119 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 CRKP46108 304 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 TM4SF4P48230 202 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ABHD8Q96I13 439 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 MEIS3Q99687 375 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 COPRSQ9NQ92 184 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 AOX1Q06278 1338 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 RASA3Q14644 834 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-201ENST00000330334 VEZTQ9HBM0 779 aa22.12■■□□□ 1.13
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