RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB22O15209 634 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPAA1O43292 621 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD1Q15327 319 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEK1Q96PY6 1258 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.07■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM4P33991 863 aa26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDR1Q08345 913 aa26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.06■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEMA3EO15041 775 aa26.05■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GYG1P46976 350 aa26.05■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.05■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBP4Q96PP9 640 aa26.03■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEAQ6S8J7 498 aa26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.02■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.01■■□□□ 1.76
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS37DQ86XT2 251 aa26.01■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.01■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGAP02671 866 aa26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMYM6O95789 1325 aa26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX11L8A8MPP1 907 aa26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARGE1O95461 756 aa26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E7EWF7 191 aa25.99■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKP1Q13835 747 aa25.99■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNA1SQ13698 1873 aa25.99■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ME3Q16798 604 aa25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AIDAQ96BJ3 306 aa25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XDHP47989 1333 aa25.98■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRK1P26718 216 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0G2JLW4 131 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALX1Q15699 326 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.96■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.96■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BBOX1O75936 387 aa25.95■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.95■■□□□ 1.75
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRD1O95696 1058 aa25.95■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST3GAL1Q11201 340 aa25.95■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXL16Q8N461 479 aa25.95■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.95■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF213O14771 459 aa25.94■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MBD4O95243 580 aa25.94■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAT2P19087 354 aa25.94■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 Q6ZUG5 572 aa25.94■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.94■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.94■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTMSP20962 102 aa25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTBP1Q14766 1721 aa25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.93■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHD4Q14839 1912 aa25.92■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMC4Q7Z404 712 aa25.92■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCF2Q9UG63 623 aa25.92■■□□□ 1.74
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGSF3O75054 1194 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms