RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 E7EWF7 191 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 GPAA1O43292 621 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 STX6O43752 255 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 SNAP23O00161 211 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 RASGRF1Q13972 1273 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 NECAB1Q8N987 351 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 FSD2A1L4K1 749 aa25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 NFIXQ14938 502 aa25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 Q6ZUG5 572 aa25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SNRNP25-201ENST00000293861 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE6AP16499 860 aa25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXL16Q8N461 479 aa25.51■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 FGAP02671 866 aa25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 BCAMP50895 628 aa25.5■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.49■■□□□ 1.67
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SNRNP25-201ENST00000293861 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0G2JLW4 131 aa25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 NPHP1O15259 732 aa25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K12Q12852 859 aa25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF3C6Q969F1 213 aa25.49■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 CNBD1Q8NA66 436 aa25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.48■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 GYS1P13807 737 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 TM4SF1P30408 202 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 TXNRD1Q16881 649 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 F13A1P00488 732 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 PDCP20941 246 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 MTMR6Q9Y217 621 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.47■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 CHD4Q14839 1912 aa25.46■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.46■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 BRF1Q92994 677 aa25.46■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.45■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.45■■□□□ 1.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ZMYM6O95789 1325 aa25.45■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.45■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PLSCR1O15162 318 aa25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PFKFB2O60825 505 aa25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ALX1Q15699 326 aa25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF213O14771 459 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 FGD1P98174 961 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PROM2Q8N271 834 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 MBD3O95983 291 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 EVCP57679 992 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 GPT2Q8TD30 523 aa25.43■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 GYG1P46976 350 aa25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 STK3Q13188 491 aa25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 AIDAQ96BJ3 306 aa25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.42■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 SEMA3EO15041 775 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 GRAPQ13588 217 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 NCOA7Q8NI08 942 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 HAND2P61296 217 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ST5P78524 1137 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.41■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB22O15209 634 aa25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS37DQ86XT2 251 aa25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 SERPINB2P05120 415 aa25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 MCM5P33992 734 aa25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 SCRN1Q12765 414 aa25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.39■■□□□ 1.66
SNRNP25-201ENST00000293861 CACNA1SQ13698 1873 aa25.39■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.39■■□□□ 1.65
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