RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.59■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GUL7 405 aa27.59■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.59■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 VPS37DQ86XT2 251 aa27.58■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.58■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB22O15209 634 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 PHKA1P46020 1223 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 XAGE2Q96GT9 111 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 CRBNQ96SW2 442 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 GPR108Q9NPR9 543 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.56■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 GRIK5Q16478 980 aa27.55■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 CCDC102BQ68D86 513 aa27.55■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 CNTROBQ8N137 903 aa27.55■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 MYOZ2Q9NPC6 264 aa27.55■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 HSPA6P17066 643 aa27.54■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa27.54■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 PASKQ96RG2 1323 aa27.54■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.53■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 TNNI3KQ59H18 835 aa27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.52■■■□□ 2
SYF2-201ENST00000236273 HMMRO75330 724 aa27.51■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 MMP14P50281 582 aa27.51■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 SCARF1Q14162 830 aa27.5■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 OGFOD1Q8N543 542 aa27.5■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 F8W031 263 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 NBPF9Q3BBW0 867 aa27.49■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.49■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.49■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 WNT10BO00744 389 aa27.48■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.48■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 RASGRF1Q13972 1273 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 CEP350Q5VT06 3117 aa27.47■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3EO15041 775 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 APLP1P51693 650 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 DLK2Q6UY11 383 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 TRAF5O00463 557 aa27.45■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.45■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.45■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
SYF2-201ENST00000236273 AOX1Q06278 1338 aa27.45■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 HTRA3P83110 453 aa27.44■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.44■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 GGA3Q9NZ52 723 aa27.44■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 CFAP100Q494V2 611 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 USP48Q86UV5 1035 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 DCTPP1Q9H773 170 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.43■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 RAB11FIP3O75154 756 aa27.42■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.42■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.42■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa27.42■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 APBB1O00213 710 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 PI16Q6UXB8 463 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE6P0CI01 402 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 MCAMP43121 646 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 DLGAP5Q15398 846 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 GORABQ5T7V8 394 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 CST9Q5W186 159 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SYF2-201ENST00000236273 MRIQ9BWK5 157 aa27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms