RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.42■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.42■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 PDE8AO60658 829 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 OPTNQ96CV9 577 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.41■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.4■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ELP3Q9H9T3 547 aa21.4■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.4■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GUL6 1792 aa21.4■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 DLGAP5Q15398 846 aa21.39■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.39■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.38■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 GJA8P48165 433 aa21.38■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CCL15Q16663 113 aa21.38■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.38■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 MGAMO43451 1857 aa21.38■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 AOX1Q06278 1338 aa21.37■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 GNRH1P01148 92 aa21.37■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 KLRK1P26718 216 aa21.37■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 PRMT2P55345 433 aa21.37■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CLRN2A0PK11 232 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 TLR2O60603 784 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 HOXB7P09629 217 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2IP78347 998 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 GPR153Q6NV75 609 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CERS5Q8N5B7 392 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 HYPKQ9NX55 129 aa21.36■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 GJB1P08034 283 aa21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 SPDYE6P0CI01 402 aa21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2A2P52657 109 aa21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 RIPK4P57078 832 aa21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.35■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 TTC28Q96AY4 2481 aa21.34■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CHL1O00533 1208 aa21.34■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 KIF22Q14807 665 aa21.34■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.34■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTGFP29279 349 aa21.33■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTSWP56202 376 aa21.33■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 RASA3Q14644 834 aa21.33■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 VEZTQ9HBM0 779 aa21.33■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.33■■□□□ 1.01
SPCS1-201ENST00000233025 MYO1BO43795 1136 aa21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 CCL5P13501 91 aa21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP100Q494V2 611 aa21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB123Q8N688 67 aa21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 MYD88Q99836 296 aa21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 VGLL4Q14135 290 aa21.31■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 Q7L0L9 218 aa21.31■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 STAP2Q9UGK3 403 aa21.31■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 SRRDQ9UH36 339 aa21.31■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 GRK4P32298 578 aa21.3■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA2Q08379 1002 aa21.3■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.3■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 GREM2Q9H772 168 aa21.3■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 EYSQ5T1H1 3165 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM47Q96LD4 638 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 RNF208Q9H0X6 261 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 CD209Q9NNX6 404 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.29■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 BTBD19C9JJ37 291 aa21.28■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 EVI5O60447 810 aa21.28■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 14e-11■□□□□ 11
SPCS1-201ENST00000233025 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 TEPSINQ96N21 525 aa21.28■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 F8W031 263 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPP22059 807 aa21.27■■□□□ 1
SPCS1-201ENST00000233025 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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