RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 MED23Q9ULK4 1368 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 NFKBIEO00221 500 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 PRELPP51888 382 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 CNTROBQ8N137 903 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 FSD1Q9BTV5 496 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 MXD3Q9BW11 206 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 IL25Q9H293 177 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 COL4A5P29400 1685 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 PPIP5K2O43314 1243 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 GRIK5Q16478 980 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 FBXW7Q969H0 707 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 EVI5LQ96CN4 794 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 ABCF2Q9UG63 623 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 G3V3G9 751 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 EYA3Q99504 573 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 SCN9AQ15858 1988 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 GTF2IP78347 998 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 FAM227BQ96M60 508 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT1-201ENST00000211413 ECE2O60344 883 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 IL1R1P14778 569 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 CHMLP26374 656 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 PSMD1Q99460 953 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 YDJCA8MPS7 323 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 NFKBIBQ15653 356 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 CDC45O75419 566 aa22.5■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.5■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 COA1Q9GZY4 146 aa22.5■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.5■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 PRDX5P30044 214 aa22.49■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 SOGA3Q5TF21 947 aa22.49■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.48■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.48■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 A0A0D9SFI3 127 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF384Q8TF68 577 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 RAD17O75943 681 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 CERS5Q8N5B7 392 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 RAI14Q9P0K7 980 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT1-201ENST00000211413 F8W031 263 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MYH7P12883 1935 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 SEMA3EO15041 775 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 BECN1Q14457 450 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 DOCK2Q92608 1830 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 PDE6AP16499 860 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 GPR162Q16538 588 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 PODNQ7Z5L7 613 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 OSBP2Q969R2 916 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 M0R2C6 588 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ADD2P35612 726 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MECOMQ03112 1051 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 NIM1KQ8IY84 436 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K12Q12852 859 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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