RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 PSPNO60542 156 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 SERPINA3P01011 423 aa6.8□□□□□ -1.32
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SMAD4-215ENST00000592911 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMAD4-215ENST00000592911 NDE1Q9NXR1 346 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 VSIG4Q9Y279 399 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-215ENST00000592911 A0A1B0GTI1 187 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 H3BN98 237 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 ENTPD6O75354 484 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 OR8U9P0C7N5 309 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CGB3P0DN86 165 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD4-215ENST00000592911 CGB7P0DN87 165 aa6.77□□□□□ -1.33
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