RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 GTF2F2P13984 249 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ALOX5APP20292 161 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB5AP20339 215 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ACTR1BP42025 376 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SSR2P43308 183 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 POU3F4P49335 361 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB5CP51148 216 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRKXP51817 358 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ATP1B3P54709 279 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R31P59538 309 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PRPS1P60891 318 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SMCO1Q147U7 214 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RHEBQ15382 184 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF141Q15928 474 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2B11Q5JQS5 317 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ACER2Q5QJU3 275 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C9orf64Q5T6V5 341 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PLPP4Q5VZY2 271 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB12Q6IQ22 244 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C10orf53Q8N6V4 93 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MFSD9Q8NBP5 474 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR8G5Q8NG78 346 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR7G2Q8NG99 324 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TM4SF19Q96DZ7 209 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PHB2Q99623 299 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GAL3ST1Q99999 423 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GGACTQ9BVM4 153 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SYT4Q9H2B2 425 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 EXO5Q9H790 373 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB18Q9NP72 206 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TAC3Q9UHF0 121 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 VSIG4Q9Y279 399 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A087WUJ7 227 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A087WWC5 75 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GWA3 101 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NDUFAF8A1L188 74 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF860A6NHJ4 632 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR2AT4A6NND4 320 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C9JQL5 133 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LMO7DNF2Z398 122 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF264O43296 627 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TGOLN2O43493 480 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FADS1O60427 444 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CXCL14O95715 111 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 F10P00742 488 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF806P0C7X5 589 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ZNF883P0CG24 379 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PTHLHP12272 177 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PGAM2P15259 253 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FOSL2P15408 326 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 HPGDP15428 266 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FUT1P19526 365 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NFYBP25208 207 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 LAP3P28838 519 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 GPR183P32249 361 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 OR1D2P34982 312 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 KIR3DL2P43630 455 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RIDAP52758 137 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 EFNB2P52799 333 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TMEM50BP56557 158 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 CLDN12P56749 244 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SLC26A5P58743 744 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R60P59551 318 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 SPCS3P61009 180 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 NTHL1P78549 312 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 QRFPP83859 136 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R1AQ13522 171 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 FAM189A2Q15884 450 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 RAB11BQ15907 218 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 ACKR1Q16570 336 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.11□□□□□ -1.75
TRDN-204ENST00000542443 PYY3Q5JQD4 70 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms