RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 DCUN1D4Q92564 292 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SPRY3O43610 288 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CECR9P0C854 216 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF728P0DKX0 622 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CHATP28329 748 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 EDDM3AQ14507 147 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM128Q5BJH2 165 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RFESDQ8TAC1 157 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 MUCL1Q96DR8 90 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CLCF1Q9UBD9 225 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 LHX6Q9UPM6 363 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF175Q9Y473 711 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SLC34A2O95436 690 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 DIRAS3O95661 229 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 TEX261Q6UWH6 196 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 DNM1P46Q6ZS02 220 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 WFDC8Q8IUA0 241 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 S100PBPQ96BU1 408 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 C10orf35Q96D05 121 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 STARD4Q96DR4 205 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 LIME1Q9H400 295 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 MBD2Q9UBB5 411 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RNF150Q9ULK6 438 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 U3KQ87 197 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 LRBAP50851 2863 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 GABRA2P47869 451 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 LRP11Q86VZ4 500 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF573Q86YE8 665 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 DKK4Q9UBT3 224 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RAXQ9Y2V3 346 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 AQP7O14520 342 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SMPD2O60906 423 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB25P24278 435 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CBX5P45973 191 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RTP5Q14D33 572 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 TMUB2Q71RG4 321 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 OR51H1Q8NH63 302 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 MED30Q96HR3 178 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ASF1BQ9NVP2 202 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 GPR132Q9UNW8 380 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 PRRG2O14669 202 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF154Q13106 437 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SCCPDHQ8NBX0 429 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 WNT2BQ93097 391 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM100Q9NV29 134 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0B4J2A0 478 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RRP8O43159 456 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 IGHG3P01860 377 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CD37P11049 281 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 AADACP22760 399 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 CFPP27918 469 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 S100A11P31949 105 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 ASCL1P50553 236 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 FAM201AQ5SY85 155 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SPICQ8N5J4 248 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRK-216ENST00000524481 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms