RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMG1	P04279	462 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX2	P28328	305 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM3	P40198	252 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GYS2	P54840	703 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GRK1	Q15835	563 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF695	Q8IW36	515 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ITFG2	Q969R8	447 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX22	Q96L94	193 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RX4	Q99571	388 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GLS2	Q9UI32	602 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM172BP	A6NC97	362 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOD1	A6NK06	481 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL24	O00175	119 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM106CP	P0CH98	169 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HES1	Q14469	280 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52W1	Q6IF63	320 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MRO	Q9BYG7	248 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST6	Q9GZX3	395 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HES4	Q9HCC6	221 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF737	O75373	536 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS3	O75911	302 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	AMY1A	P04745	511 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAT	P28329	748 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	BDH1	Q02338	343 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CGB2	Q6NT52	195 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT74	Q7RTS7	529 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF23	Q7RTU1	214 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD1	Q8N668	190 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8U1	Q8NH10	309 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP19	Q96LK0	163 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TEAD3	Q99594	435 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM206A	Q9NX38	181 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	8.54	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NIN4	97 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	DLGAP1	O14490	977 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC2	O15144	300 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP23A	O75900	390 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HAND1	O96004	215 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK2	P24941	298 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGA2	P52926	109 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRX1	P54821	245 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	IL24	Q13007	206 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE13	Q4V321	117 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLAMF9	Q96A28	289 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RAX2	Q96IS3	184 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PKIB	Q9C010	78 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511		U3KQV3	271 aa		8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	8.53	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM11	P17152	192 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOX5AP	P20292	161 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MPZ	P25189	248 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05

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