RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1N2Q8NGR9 330 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR9G1Q8NH87 305 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MROQ9BYG7 248 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCG5Q9H222 651 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GHITMQ9H3K2 345 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GORASP2Q9H8Y8 452 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB1Q9HAE3 211 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARMC1Q9NVT9 282 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCLOQ9Y6V0 5065 aa12.88□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A8MZ25 164 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OVOL1O14753 267 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1D-33P01593 117 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1-33P01594 117 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALOX5APP20292 161 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDNFP39905 211 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGFRP43088 359 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR3A1P47881 315 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB7AP51149 207 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF91Q05481 1191 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HACD2Q6Y1H2 254 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDB2Q92466 427 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLAMF9Q96A28 289 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCD2Q9UBJ2 740 aa12.87□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPI3 338 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A17O43808 307 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF254O75437 659 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX14O95416 240 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VDAC1P21796 283 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RUNX1Q01196 453 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MADCAM1Q13477 382 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYPD6Q86Y78 171 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 U3KQV3 271 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 V9GYS6 101 aa12.86□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNFRSF11BO00300 401 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRODHO43272 600 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNB2O95067 398 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTRP02766 147 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX4I1P13073 169 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB8P28062 276 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFHR3Q02985 330 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF146Q15072 292 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIN3Q5JUX0 258 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AQP11Q8NBQ7 271 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT84Q9NSB2 600 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R1Q9NYW7 299 aa12.85□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 I3L521 148 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPZL2O60487 215 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INMTO95050 263 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5H8P0DN80 308 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFYBP25208 207 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EBI3Q14213 229 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A26Q70HW3 274 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF679Q8IYX0 411 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR14K1Q8NGZ2 314 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEX47Q8TBZ9 253 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYOZ3Q8TDC0 251 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCUN1D4Q92564 292 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EME1Q96AY2 570 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOB1AQ9H8S9 216 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL36RNQ9UBH0 155 aa12.84□□□□□ -0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ODAMA1E959 279 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 J3QR06 171 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYB5AP00167 134 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP1P28562 367 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR3DL2P43630 455 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLIPR1P48060 266 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTNR1BP49286 362 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FUT6P51993 359 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIDAP52758 137 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISL1P61371 349 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROM1Q03395 351 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC35D3Q5M8T2 416 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM65Q6PI78 240 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SATL1Q86VE3 508 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM58AQ8N1B3 248 aa12.83□□□□□ -0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms