RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	IL20	Q9NYY1	176 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	hADV38S2	A0JD32	116 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM183A	A6NL82	134 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QT63	122 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QZK8	103 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF11B	O00300	401 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2F2	O95006	317 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX14	O95416	240 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LYL1	P12980	280 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PSME3	P61289	254 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ESRRG	P62508	458 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAPC1	Q16533	368 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ASRGL1	Q7L266	308 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT77	Q7Z794	578 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF148	Q8N7C7	305 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DPM3	Q9P2X0	92 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511		K7N7A8	449 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD9	O00233	223 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNB2	O95067	398 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LY86	O95711	162 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	NRAS	P01111	189 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOS	Q8NHW6	89 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CDRT15	Q96T59	188 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMAT4	Q9H898	229 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	VNN3	Q9NY84	501 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TENM2	Q9NT68	2774 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINE3	A8MV23	424 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOF	O60613	162 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT36	O76013	467 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GAST	P01350	101 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1B1	P15313	513 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRR1	P24046	479 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A1	P30531	599 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MNDA	P41218	407 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR3A4P	P47883	348 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35B1	P78383	322 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8H2	Q8N162	312 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF596	Q8TC21	504 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RCHY1	Q96PM5	261 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	DUX3	Q96PT4	197 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14A2	Q96R54	314 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR84	Q9NQS5	396 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CMC2	Q9NRP2	79 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR173	Q9NS66	373 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP57	Q9NU63	452 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RQV5	110 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE6A	A0A183	80 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LEUTX	A8MZ59	168 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BN98	237 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TOR1A	O14656	332 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC22	O60826	627 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	INMT	O95050	263 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SKAP2-209	ENST00000497511	APOL3	O95236	402 aa		8.56	□□□□□ -1.04

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