RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488087.1

ECHDC1-217, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-217ENST00000488087 PEBP4Q96S96 227 aa2.86□□□□□ -1.95
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ECHDC1-217ENST00000488087 DEFB126Q9BYW3 111 aa2.86□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 SLITRK2Q9H156 845 aa2.86□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 DEFB129Q9H1M3 183 aa2.86□□□□□ -1.95
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ECHDC1-217ENST00000488087 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
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ECHDC1-217ENST00000488087 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.85□□□□□ -1.95
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ECHDC1-217ENST00000488087 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.85□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CMBLQ96DG6 245 aa2.85□□□□□ -1.95
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ECHDC1-217ENST00000488087 ITCHQ96J02 903 aa2.85□□□□□ -1.95
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