RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471927.5

CCT7-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, human

TSL 4

Gene CCT7, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT7-208	ENST00000471927	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CCT7-208	ENST00000471927	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CCT7-208	ENST00000471927	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CCT7-208	ENST00000471927	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CCT7-208	ENST00000471927	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CCT7-208	ENST00000471927	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CCT7-208	ENST00000471927		A0A1W2PPR1	153 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	MFNG	O00587	321 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SH2D1B	O14796	132 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	WNT9B	O14905	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	DEGS1	O15121	323 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	KNG1	P01042	644 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	LPL	P06858	475 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SOD3	P08294	240 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CSF3	P09919	207 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	DANCR	P0C864	163 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	FUT3	P21217	361 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CHAT	P28329	748 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	DUSP1	P28562	367 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	PMEL	P40967	661 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	BAK1	Q16611	211 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927		A0A1W2PQ09	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SULT1C2	O00338	296 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	HAND1	O96004	215 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CD3G	P09693	182 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	PTHLH	P12272	177 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ZNF44	P15621	663 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	EGR1	P18146	543 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	DEFA1	P59665	94 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	DEFA3	P59666	94 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	PDCD1	Q15116	288 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ISPD	A4D126	451 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	FAM221A	A4D161	298 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	RBBP9	O75884	186 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CD8A	P01732	235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	MELTF	P08582	738 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CD80	P33681	288 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	TMEM50B	P56557	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ACTB	P60709	375 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ACTG1	P63261	375 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ZNF146	Q15072	292 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	HFE	Q30201	348 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CCL17	Q92583	94 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SIRPB1	O00241	398 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	CA11	O75493	328 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	LHB	P01229	141 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	HPX	P02790	462 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	AP3S2	P59780	193 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CCT7-208	ENST00000471927	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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