RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 Q8N2B8 174 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 CBR4Q8N4T8 237 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 FGGYQ96C11 551 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 ADI1Q9BV57 179 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 CHST6Q9GZX3 395 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PPE2 198 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PR64 198 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PRV1 198 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 DAPL1A0PJW8 107 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 A6NDX4 124 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 MMP23AO75900 390 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 SERPINA3P01011 423 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 CALCBP10092 127 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 POU3F4P49335 361 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 RAB13P51153 203 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 DYNLT3P51808 116 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 ATP1B3P54709 279 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 EDDM3AQ14507 147 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 HERPUD1Q15011 391 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 GRK1Q15835 563 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 RFT1Q96AA3 541 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 SPSB1Q96BD6 273 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 C4orf36Q96KX1 117 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF714Q96N38 554 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 SPACA5Q96QH8 159 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 SLC29A1Q99808 456 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 HMG20AQ9NP66 347 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 TCF19Q9Y242 345 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 E9PI62 339 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 J3QLW9 94 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 KDM4BO94953 1096 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ARG1P05089 322 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 HTR1AP08908 422 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF19P17023 458 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 PRKACAP17612 351 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 PRKACBP22694 351 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 MTCP1P56278 107 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 P2RX3P56373 397 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 LGALS4P56470 323 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 GALEQ14376 348 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 PLA1AQ53H76 456 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SYS1Q8N2H4 156 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 MALSU1Q96EH3 234 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 OPALINQ96PE5 141 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 RAB18Q9NP72 206 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 HHLA2Q9UM44 414 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 hADV38S2A0JD32 116 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 MGST3O14880 152 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 OR2H2O95918 312 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF20P17024 532 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 GABRR1P24046 479 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 PEX2P28328 305 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 GDNFP39905 211 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZP1P60852 638 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ACTA2P62736 377 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ACTG2P63267 376 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 FAM189A2Q15884 450 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 SSX2Q16385 188 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF529Q6P280 563 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 Q6P435 159 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 C11orf88Q6PI97 169 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZS46 218 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM219Q86XT9 240 aa9.63□□□□□ -0.87
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