RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP1P28562 367 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 UBA52P62987 128 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ASPHD2Q6ICH7 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SAXO1Q8IYX7 474 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D15Q8TC07 691 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 MYDGFQ969H8 173 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM106AQ96A25 262 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX22Q96L94 193 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX5Q96PT3 197 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM13Q9H4Q3 707 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 HMG20AQ9NP66 347 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS2R4Q9NYW5 299 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GLS2Q9UI32 602 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF737O75373 536 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 MYF6P23409 242 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PRTN3P24158 256 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DLX1P56177 255 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT4P56705 351 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS2R43P59537 309 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZP1P60852 638 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF146Q15072 292 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RNLSQ5VYX0 342 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SATL1Q86VE3 508 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51A2Q8NGJ7 313 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5D13Q8NGL4 314 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR13C5Q8NGS8 318 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF14Q92956 283 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOFQ9HBH0 211 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPH5 198 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM82A0PJX8 343 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SNU13P55769 128 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RIPK1Q13546 671 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9A3R2Q15599 337 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 YIF1BQ5BJH7 314 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52N4Q8NGI2 321 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PGLYRP3Q96LB9 341 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD60Q9BZ19 345 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SH2D1BO14796 132 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V1G2O95670 118 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDOBP05062 364 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CELP19835 753 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCA2AQ02747 115 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 Q499Y3 187 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SPIN3Q5JUX0 258 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 IZUMO2Q6UXV1 221 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf107Q6ZR85 190 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GDPD3Q7L5L3 318 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ORAI1Q96D31 301 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GPER1Q99527 375 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA4Q9BXL8 241 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 NOX4Q9NPH5 578 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CD1AP06126 327 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRR1P24046 479 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA13P48723 471 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 EDDM3BP56851 147 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP3R1P63098 170 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DOC2BQ14184 412 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6YL49 198 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8H2Q8N162 312 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf42Q8N5U0 333 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SGCDQ92629 289 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM138Q9NPI0 162 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0U1RQK1 487 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PRD5 423 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PRF3 423 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PRM7 423 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDN34H7C241 214 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PSPNO60542 156 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2E1P51965 193 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTG1P63261 375 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRD1Q13241 179 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF273Q14593 569 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GRK1Q15835 563 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 NCR3LG1Q68D85 454 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PXT1Q8NFP0 134 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A28Q96A46 364 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 MND1Q9BWT6 205 aa17.28■□□□□ 0.36
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