RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PRD5	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PRF3	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PRM7	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PRKACB	P22694	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PROK1	P58294	105 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		Q6ZSV7	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PNKD	Q8N490	385 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SNX22	Q96L94	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		Q96MT0	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		F8VVB4	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		F8VWA3	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	CYB5A	P00167	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MT-ND2	P03891	347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	HTR1A	P08908	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ATF1	P18846	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	DLX6	P56179	175 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR12D2	P58182	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	COL10A1	Q03692	680 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF146	Q15072	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SSX3	Q99909	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		H3BSH0	61 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	TIMM23	O14925	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MTCP1	P56278	107 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	GALE	Q14376	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF273	Q14593	569 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	FGGY	Q96C11	551 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	EBAG9	O00559	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ALX3	O95076	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHA1	P01876	353 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	CCL3L1	P16619	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF20	P17024	532 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	LGALS4	P56470	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RAB40B	Q12829	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		H3BUX3	64 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524		J3QLW9	94 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	HAND1	O96004	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF19	P17023	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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