RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	LY6L	H3BQJ8	138 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		K7N7A8	449 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF737	O75373	536 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	INMT	O95050	263 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHG2	P01859	326 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	GYPB	P06028	91 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPARC	P09486	303 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTNR1B	P49286	362 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC7A2	P52569	658 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	EDDM3A	Q14507	147 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC36A3	Q495N2	470 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEX38	Q6PEX7	206 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF561	Q8N587	486 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DRAM1	Q8N682	238 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF714	Q96N38	554 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	BAG5	Q9UL15	447 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DHRS12	A0PJE2	317 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	UNC119B	A6NIH7	251 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		I3L521	148 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC1A7	O00341	560 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OVOL1	O14753	267 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	REN	P00797	406 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CST4	P01036	141 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV1-47	P01700	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3-7	P01780	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLU	P10909	449 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	BRS3	P32247	399 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	STX1B	P61266	288 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CFHR3	Q02985	330 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR50	Q13585	617 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAF13	Q15543	124 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT71	Q3SY84	523 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF429	Q86V71	674 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIGD4	Q8IY51	512 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	POC1A	Q8NBT0	407 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR56B4	Q8NH76	319 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPC1A	Q92747	370 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHST6	Q9GZX3	395 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A8MZ25	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DIRAS1	O95057	198 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBP4	P02753	201 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	KDELR2	P33947	212 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR12	P47775	334 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	INSL3	P51460	131 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS6KA3	P51812	740 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35B1	P78383	322 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	BDH1	Q02338	343 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNLS	Q5VYX0	342 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	MOB3C	Q70IA8	216 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF152	Q8N8N0	203 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGAM5	Q96HS1	289 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52D1	Q9H346	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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