RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260810.9

TOPBP1-201, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOPBP1, Length 5,378 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-201ENST00000260810 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.71□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 H0YIZ8 118 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 SOCS1O15524 211 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 HPGDSO60760 199 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 SLC35A1P78382 337 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 TXN2Q99757 166 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 BABAM2Q9NXR7 383 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 MUCL1Q96DR8 90 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 BTBD17A6NE02 478 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 C15orf65H3BRN8 121 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 SLC16A7O60669 478 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 MED6O75586 246 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 TRAPPC6AO75865 159 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 HCKP08631 526 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 TMEM244Q5VVB8 128 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 AQP3Q92482 292 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.7□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 SLC25A18Q9H1K4 315 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 PTTG3PQ9NZH4 202 aa4.7□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa4.69□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 MELTFP08582 738 aa4.69□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF32P17041 273 aa4.69□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 NR4A2P43354 598 aa4.69□□□□□ -1.66
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TOPBP1-201ENST00000260810 CHRFAM7AQ494W8 412 aa4.69□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 BCL2L15Q5TBC7 163 aa4.69□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 LEG1Q6P5S2 330 aa4.69□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 CD177Q8N6Q3 437 aa4.69□□□□□ -1.66
TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF283Q8N7M2 679 aa4.69□□□□□ -1.66
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