RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 GCM1Q9NP62 436 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 V9GY05 133 aa8.27□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 LRP5LA4QPB2 252 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 A6NIN4 97 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 AIPO00170 330 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PIN1P1O15428 100 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MPIG6BO95866 241 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 UBBP0CG47 229 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TNFRSF1AP19438 455 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CFPP27918 469 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SSTR2P30874 369 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEB1P43366 347 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PPOXP50336 477 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 RORCP51449 518 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MMP15P51511 669 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MTCP1P56278 107 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SCAND1P57086 179 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TNK1Q13470 666 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 RIN1Q13671 783 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 RAB11BQ15907 218 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 DGUOKQ16854 277 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 AWAT2Q6E213 333 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF611Q8N823 705 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 C14orf79Q96F83 325 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 EDARQ9UNE0 448 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.26□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GWJ7 208 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM64BA6NI03 449 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 C17orf100A8MU93 164 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CTAG2O75638 210 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PLAUP00749 431 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PRF1P14222 555 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CD200P41217 278 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ALDH3B1P43353 468 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 GPM6AP51674 278 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SPCS2Q15005 226 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 KISS1Q15726 138 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2V2Q15819 145 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 FAM189A2Q15884 450 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 DTX2Q86UW9 622 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 LRP11Q86VZ4 500 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 NEUROG1Q92886 237 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ERGIC1Q969X5 290 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 RNF170Q96K19 258 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TPK1Q9H3S4 243 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MSL2Q9HCI7 577 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 DECR2Q9NUI1 292 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 GHRLQ9UBU3 117 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 IL19Q9UHD0 177 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PLCE1Q9P212 2302 aa8.25□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 TENM4Q6N022 2769 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CADP27708 2225 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 A6NLC8 198 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC30A6NM36 301 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 IFITM5A6NNB3 132 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF732B4DXR9 585 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 J3QT63 122 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 IFNL4K9M1U5 179 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SLC17A2O00624 439 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 MLNRO43193 412 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 SPRY3O43610 288 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 CD55P08174 381 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 ADH4P08319 380 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 IRF2P14316 349 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-211ENST00000497210 HTR2CP28335 458 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms