RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GORABQ5T7V8 394 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR6B2Q6IFH4 312 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DCXRQ7Z4W1 244 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC35E3Q7Z769 313 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GLRX5Q86SX6 157 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC35F2Q8IXU6 374 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DHRSXQ8N5I4 330 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLPP5Q8NEB5 264 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5J2Q8NH18 312 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5P2Q8WZ92 322 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC39A13Q96H72 371 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C12orf66Q96MD2 445 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR8B4Q96RC9 309 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GABRG3Q99928 467 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC30A2Q9BRI3 323 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARL6Q9H0F7 186 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSD3B7Q9H2F3 369 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PIGUQ9H490 435 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACP6Q9NPH0 428 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKEF1Q9NU02 776 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DCAF16Q9NXF7 216 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RDH8Q9NYR8 311 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TBK1Q9UHD2 729 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LAMC1P11047 1609 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PTPRBP23467 1997 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAH2Q9P225 4427 aa-1.35□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LRP5LA4QPB2 252 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C2orf70A6NJV1 201 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANGPT2O15123 496 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCL25O15444 150 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NME2P1O60361 137 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KERAO60938 352 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GPR75O95800 540 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AGR2O95994 175 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CECR9P0C854 216 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HLA-GP17693 338 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TEAD1P28347 426 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TSPOP30536 169 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BMI1P35226 326 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HPCAL1P37235 193 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 QARSP47897 775 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MYBPC1Q00872 1141 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COX6A2Q02221 97 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ECH1Q13011 328 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAB1Q13506 487 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 QPRTQ15274 297 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAPRE2Q15555 327 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CATSPER4Q7RTX7 472 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM57AQ8TBR7 257 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TCP10LQ8TDR4 215 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GIPC3Q8TF64 312 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NSMCE2Q96MF7 247 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 Q96NJ1 140 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MICU1Q9BPX6 476 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 THTPAQ9BU02 230 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DOHHQ9BU89 302 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TSSK6Q9BXA6 273 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKRD60Q9BZ19 345 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ULBP1Q9BZM6 244 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AZI2Q9H6S1 392 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM153AQ9UHL3 310 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GMEB1Q9Y692 573 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LAMA1P25391 3075 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A087WV48 116 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 XKRY2A2RUG3 117 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SYCE1LA8MT33 242 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HMSDA8MTL9 139 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 H0YC42 278 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSD17B6O14756 317 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NDC80O14777 642 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MPZL2O60487 215 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FMO6PO60774 539 aa-1.36□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms