RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533459.1

AP002989.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002989.1, Length 562 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002989.1-201ENST00000533459 TNFSF11O14788 317 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 CXCL13O43927 109 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 KRT36O76013 467 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 DIRAS1O95057 198 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 IGHG1P01857 330 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RBP1P09455 135 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 PAX9P55771 341 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RAB11AP62491 216 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NAB1Q13506 487 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RAB11BQ15907 218 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 SPIN4Q56A73 249 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 Q6ZSR3 168 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 MARCH3Q86UD3 253 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 OR2L13Q8N349 312 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 STPG4Q8N801 248 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 SDSLQ96GA7 329 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ARL5BQ96KC2 179 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF681Q96N22 645 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 HBEGFQ99075 208 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 GPR22Q99680 433 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RBBP8Q99708 897 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZFP57Q9NU63 452 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 STK38LQ9Y2H1 464 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.38□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ROS1P08922 2347 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 A0A0J9YW62 118 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 E7EQL1 145 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 E9PQ18 207 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 CHST1O43916 411 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 SMIM24O75264 130 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 KLHL2O95198 593 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 UTS2O95399 124 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NUDT14O95848 222 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ALPLP05186 524 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 WNT2P09544 360 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ALOX5P09917 674 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 GSTM3P21266 225 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 PRKACBP22694 351 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 STOMP27105 288 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NTSP30990 170 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 GABRA3P34903 492 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 PRPS1P60891 318 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 DR1Q01658 176 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 CALCOCO2Q13137 446 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 GTDC1Q4AE62 458 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 REP15Q6BDI9 236 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 MICU2Q8IYU8 434 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RNF175Q8N4F7 328 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 GPR151Q8TDV0 419 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 RAB1CQ92928 201 aa3.37□□□□□ -1.87
AP002989.1-201ENST00000533459 NABP1Q96AH0 204 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms