RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		8.74	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		8.74	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		8.74	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRQ8	180 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2AT4	A6NND4	320 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BUI4	141 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	F2RL2	O00254	374 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCR6	O00574	342 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA1	P01009	418 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ANOS1	P23352	680 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRA1	P23415	457 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD11B1	P28845	292 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	PYCR1	P32322	319 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OMP	P47874	163 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB13	P51153	203 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-11	P60412	298 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CD83	Q01151	205 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ROM1	Q03395	351 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	DGCR6	Q14129	220 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT72	Q14CN4	511 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPRE2	Q15555	327 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	SNCB	Q16143	134 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL22	Q53GT1	634 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ5	Q5HYK3	327 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	HCP5	Q6MZN7	132 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N2B8	174 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52J3	Q8NH60	311 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	STON2	Q8WXE9	905 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM162A	Q96A26	154 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CHID1	Q9BWS9	393 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52D1	Q9H346	318 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	SP140L	Q9H930	580 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	NLK	Q9UBE8	527 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF19	Q9Y242	345 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		8.73	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C68	A6NDL8	312 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF878	C9JN71	531 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC3	O15145	178 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC15A1	P46059	708 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CX3CR1	P49238	355 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	FXYD6P3	P58550	94 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM3A	P98173	230 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIB	Q01892	262 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF144B	Q7Z419	303 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC13	Q9H3R2	512 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB21	Q9UL25	225 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	8.72	□□□□□ -1.01
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM210	A6NLX4	147 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNGR1	O43759	233 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPE	Q05469	1076 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDX4	Q13162	271 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX2	Q16385	188 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM57B	Q71RH2	274 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TIGD4	Q8IY51	512 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T4	Q8NH00	348 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PIFO	Q8TCI5	191 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SPSB4	Q96A44	273 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PGAM5	Q96HS1	289 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF170	Q96K19	258 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf21	Q9H246	121 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		8.71	□□□□□ -1.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGBP	Q9NV56	204 aa		8.71	□□□□□ -1.02

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