RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488087.1

ECHDC1-217, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-217ENST00000488087 TPST2O60704 377 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GGCTO75223 188 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 MED6O75586 246 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GJB5O95377 273 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 F10P00742 488 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PTHP01270 115 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 IFNA17P01571 189 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TCRBP04435 133 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 IL5P05113 134 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ANXA5P08758 320 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR8U8P0C7N1 319 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GKN3PP0CG01 181 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CT45A10P0DMU9 189 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF44P15621 663 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 NCK1P16333 377 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 MGMTP16455 207 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CXCL2P19875 107 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CXCL3P19876 107 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CNR1P21554 472 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TUBG1P23258 451 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GDF1P27539 372 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 BTCP35070 178 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CDKN1BP46527 198 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 INPP1P49441 399 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC25A1P53007 311 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 HCCSP53701 268 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR4D2P58180 307 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 RAB10P61026 200 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 RAP1BP61224 184 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 DEFA5Q01523 94 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TNFRSF9Q07011 255 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CYP24A1Q07973 514 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 FABP9Q0Z7S8 132 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TPBGQ13641 420 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GPR176Q14439 515 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GANABQ14697 944 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PEA15Q15121 130 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TSNQ15631 228 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 HMGN3Q15651 99 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 XKR7Q5GH72 579 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 FAM74A1Q5RGS3 127 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PHYHD1Q5SRE7 291 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM244Q5VVB8 128 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR2T5Q6IEZ7 315 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 MED27Q6P2C8 311 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 SPNS3Q6ZMD2 512 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ABHD13Q7L211 337 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TPRA1Q86W33 373 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PARGQ86W56 976 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 DAW1Q8N136 415 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PQLC3Q8N755 202 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GPR26Q8NDV2 337 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR5T1Q8NG75 326 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR9I1Q8NGQ6 314 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR2T29Q8NH02 315 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OR5J2Q8NH18 312 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 DTD1Q8TEA8 209 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GTSF1Q8WW33 167 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM203Q969S6 136 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OTUB2Q96DC9 234 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 KCTD7Q96MP8 289 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 MCEEQ96PE7 176 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 VAT1Q99536 393 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PKMYT1Q99640 499 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CHST5Q9GZS9 411 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 HEBP1Q9NRV9 189 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 VNN3Q9NY84 501 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 EHFQ9NZC4 300 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 CALML5Q9NZT1 146 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PIPOXQ9P0Z9 390 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 PISDQ9UG56 409 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF222Q9UK12 451 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 V9GYQ6 96 aa2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ECHDC1-217ENST00000488087 OTOFQ9HC10 1997 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms