RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 MEMO1Q9Y316 297 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 IFNA2P01563 188 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PTGER4P35408 488 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 RTL6Q6ICC9 239 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 WNT2BQ93097 391 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PIGQQ9BRB3 760 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 CA11O75493 328 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PPA1Q15181 289 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 MST1LQ2TV78 715 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM88Q6PEY1 159 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 OPN5Q6U736 354 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TREM1Q9NP99 234 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 VAMP5O95183 116 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SERPINA5P05154 406 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 CYC1P08574 325 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 CCL3P10147 92 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 C10orf91Q5T1B1 145 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 IL34Q6ZMJ4 242 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 Q6ZSR3 168 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 FOXRED2Q8IWF2 684 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 C10orf35Q96D05 121 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 G3V3Y1 287 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 RBMXP38159 391 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF84P51523 738 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SPTSSAQ969W0 71 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 HPF1Q9NWY4 346 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 APOC1P02654 83 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 LIFP15018 202 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ULBP2Q9BZM5 246 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 WDR54Q9H977 334 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PJVKQ0ZLH3 352 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 FBXO17Q96EF6 278 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 HRH4Q9H3N8 390 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 GPR173Q9NS66 373 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 DKKL1Q9UK85 242 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZIC3O60481 467 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM225BP0DP42 221 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ECI1P42126 302 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SULF2Q8IWU5 870 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 Q96M66 194 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 MUC3AQ02505 3323 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 MTCP1P56278 107 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ESX1Q8N693 406 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 CCDC54Q8NEL0 328 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SGK3Q96BR1 496 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PROK2Q9HC23 129 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TAAR5O14804 337 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 H2AFB1P0C5Y9 115 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 HKR1P10072 659 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SGPP2Q8IWX5 399 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 LRP3O75074 770 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF708P17019 499 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 CBLN2Q8IUK8 224 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 SMIM8Q96KF7 97 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf40-201ENST00000376854 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms