RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TCF21O43680 179 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LANCL1O43813 399 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ORC5O43913 435 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KRT34O76011 436 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TDP2O95551 362 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GGPS1O95749 300 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CRYGDP07320 174 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBBP0CG47 229 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UQCRBP14927 111 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GLRA2P23416 452 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 S100A2P29034 98 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CASP3P42574 277 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LPAR6P43657 344 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CASP4P49662 377 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UGT2B15P54855 530 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AQP4P55087 323 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TNFRSF17Q02223 184 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MXD1Q05195 221 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5I1Q13606 314 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 INAQ16352 499 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HYAL4Q2M3T9 481 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HFEQ30201 348 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RILPL1Q5EBL4 403 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KRBOX4Q5JUW0 171 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HECTD3Q5T447 861 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF550Q7Z398 422 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKRD37Q7Z713 158 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CTAGE6Q86UF2 777 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KIF2BQ8N4N8 673 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MS4A15Q8N5U1 240 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SAMD3Q8N6K7 520 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZDHHC22Q8N966 263 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR2T34Q8NGX1 318 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR10R2Q8NGX6 335 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR2T3Q8NH03 318 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DCAKDQ8WVC6 231 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MUCL1Q96DR8 90 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ERO1AQ96HE7 468 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EPSTI1Q96J88 318 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSFY1Q96LI6 401 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SCLT1Q96NL6 688 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OXGR1Q96P68 337 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EDEM3Q9BZQ6 932 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IMUPQ9GZP8 106 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NRBP2Q9NSY0 501 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AIPL1Q9NZN9 384 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BTRCQ9Y297 605 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM5Q9Y2B1 443 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SETD5Q9C0A6 1442 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC7Q96M83 1385 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ELP1O95163 1332 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A087WSZ3 146 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A0G2JMP0 313 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A0X1KG70 313 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM72A0PK05 275 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HTR3EA5X5Y0 456 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM212A6NML5 194 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A8MWP6 167 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAGEB3O15480 346 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GNRH2O43555 120 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC25A20O43772 301 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GFPT2O94808 682 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLEKHA8P1O95397 391 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CA3P07451 260 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GUSBP08236 651 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GGT1P19440 569 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NDUFA8P51970 172 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC18A1P54219 525 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACTG2P63267 376 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCZ1BP86790 482 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSG9Q00887 426 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IFITM3Q01628 133 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COG2Q14746 738 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GABRA6Q16445 453 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM241Q24JQ0 296 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC36A3Q495N2 470 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IFI44LQ53G44 452 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms