RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225648.3

HOXB6-201, Transcript of homeobox B6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB6, Length 1,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6-201ENST00000225648 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 UPK1BO75841 260 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 TNFSF8P32971 234 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 MTNR1BP49286 362 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 CDK5R1Q15078 307 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 WDR38Q5JTN6 314 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 FDX2Q6P4F2 183 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 AP3S1Q92572 193 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 ITFG2Q969R8 447 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 CST4P01036 141 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 PMELP40967 661 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 KIR3DL2P43630 455 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 MAP2K3P46734 347 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 KRTAP1-1Q07627 177 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 INSL4Q14641 139 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 BIVMQ86UB2 503 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 SMIM19Q96E16 107 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 ISPDA4D126 451 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 LRP5LA4QPB2 252 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 P2RY10O00398 339 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 CCL1P22362 96 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 TGM4P49221 684 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 OXA1LQ15070 435 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 MPPED2Q15777 294 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 COMMD2Q86X83 199 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 FTMTQ8N4E7 242 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 SPERTQ8NA61 448 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 ITPKCQ96DU7 683 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 CEP19Q96LK0 163 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXB6-201ENST00000225648 DHRS3O75911 302 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 SLC3A1Q07837 685 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 ODF4Q2M2E3 257 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 MOGAT3Q86VF5 341 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 GHSRQ92847 366 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 MPC1Q9Y5U8 109 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 V9GYS6 101 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 LY6G6DO95868 133 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 SERPINA3P01011 423 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 PRDX4Q13162 271 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 AVPI1Q5T686 147 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 WDR86Q86TI4 376 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 RDH10Q8IZV5 341 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 PIGLQ9Y2B2 252 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 V9GYH0 126 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 TMEM178BH3BS89 294 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 FAHP16930 419 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 CALRP27797 417 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 IL2RGP31785 369 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 GNALP38405 381 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 CCR9P51686 369 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 ZBTB37Q5TC79 503 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 DOK3Q7L591 496 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 TPRA1Q86W33 373 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 LYSMD2Q8IV50 215 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 LAX1Q8IWV1 398 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 Q8TCH9 128 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 OR5P3Q8WZ94 311 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 PIGCQ92535 297 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 ERGIC1Q969X5 290 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 CCDC32Q9BV29 185 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 RGS5O15539 181 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 DDI2Q5TDH0 399 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 TMEM42Q69YG0 159 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 OR8S1Q8NH09 359 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXB6-201ENST00000225648 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms