RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF24P17028 368 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CCL11P51671 97 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM50BP56557 158 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MEF2DQ14814 521 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 Q5BKY6 102 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM42Q69YG0 159 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SPICQ8N5J4 248 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PIGTQ969N2 578 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SPSB4Q96A44 273 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GP6Q9HCN6 339 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GPR173Q9NS66 373 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ING4Q9UNL4 249 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 M0QYG6 137 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SOCS1O15524 211 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 XRCC2O43543 280 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 IGHG3P01860 377 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 EDN3P14138 238 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MPZP25189 248 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CXADRP78310 365 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FAM3AP98173 230 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR8B8Q15620 311 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RAB3CQ96E17 227 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DLL4Q9NR61 685 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF175Q9Y473 711 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ATRXP46100 2492 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 A0A096LPE4 126 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPZ6 126 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MFNGO00587 321 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SSX5O60225 188 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RLN1P04808 185 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MGMTP16455 207 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TBPP20226 339 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PRKACBP22694 351 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 AGTR1P30556 359 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GNG2P59768 71 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PMP22Q01453 160 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF92Q03936 586 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYND11Q15326 602 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 S100A13Q99584 98 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 IFT46Q9NQC8 304 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF69Q9UC07 566 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR14I1A6ND48 311 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC22A20A6NK97 555 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DISC1C4P0D8 188 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NAT1P18440 290 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINA2P20848 420 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC6A7Q99884 636 aa7.11□□□□□ -1.27
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