RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 PLK3Q9H4B4 646 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ZMAT4Q9H898 229 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 NOX4Q9NPH5 578 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 STARD10Q9Y365 291 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GTI1 187 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SHISA9B4DS77 424 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 H3BSH0 61 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 C19orf84I3L1E1 186 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SULT1B1O43704 296 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 RNF224P0DH78 156 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF250P15622 560 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 MTNR1BP49286 362 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 EVX1P49640 407 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 PSMD7P51665 324 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CD276Q5ZPR3 534 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TPRA1Q86W33 373 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ACBD4Q8NC06 268 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR8S1Q8NH09 359 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 FGGYQ96C11 551 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 HAVCR1Q96D42 359 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CMBLQ96DG6 245 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 C16orf92Q96LL3 132 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 FLNCQ14315 2725 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 A1L4Q6 167 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 DPPA5A6NC42 116 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR5B21A6NL26 309 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 H3BMQ9 156 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 M0R233 179 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM127O75204 238 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 GPX5O75715 221 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CST4P01036 141 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 NRASP01111 189 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 IL1AP01583 271 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-13P01766 116 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 HCKP08631 526 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR4A8P0C604 315 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 PRKACBP22694 351 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TNFSF4P23510 183 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 THBS2P35442 1172 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SOX6P35712 828 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINB10P48595 397 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 FABP6P51161 128 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ERVS71-1P61550 626 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 PSG7Q13046 419 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 EFNB3Q15768 340 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ADIPOQQ15848 244 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CTF1Q16619 201 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR2T2Q6IF00 324 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 SPERTQ8NA61 448 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 MICU1Q9BPX6 476 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CENPOQ9BU64 300 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 POFUT1Q9H488 388 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 COL12A1Q99715 3063 aa8.3□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 LRRK2Q5S007 2527 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 C5orf63A6NC05 138 aa8.29□□□□□ -1.08
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM210A6NLX4 147 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms